1. 初版（Normal Version）
最早的《三国战纪》版本，奠定了游戏的基本框架。
- 角色：初始可选赵云、关羽、张飞、黄忠、马超
- 必杀技：基础火剑、雷剑、冰剑、电剑
- 隐藏人物：诸葛亮（需特定条件解锁）
- 特点：操作简单，难度适中，是许多玩家的入门版本
2. 加强版（Plus / 112/113版）
在初版基础上进行优化，增加了新角色和技能。
- 新增角色：小乔、貂蝉、张辽
- 新武器：风剑、爆剑、幻剑
- 系统改进：连招更流畅，AI难度提升
- 版本号：常见为1.12、1.13，故称112/113版
3. 乱世枭雄（2代，Sango Fighter 2）
2001年推出的续作，画面和系统全面升级。
- 画面：采用新引擎，画面更精细
- 角色：新增孙权、曹操、刘备等君主角色
- 技能系统：引入“元神变身”系统
- 剧情：更贴近三国演义，关卡设计更丰富
4. 版本对比表
| 版本 | 发布时间 | 主要角色 | 特色系统 | 备注 |
|---|---|---|---|---|
| 初版 | 1998年 | 五虎上将 | 基础武器切换 | 经典入门版本 |
| 加强版 | 1999-2000年 | 五虎+文官 | 新增风爆幻三剑 | 最流行版本 |
| 乱世枭雄 | 2001年 | 君主+名将 | 元神变身 | 正统续作 |
5. 其他非官方版本
由于游戏火爆，后期出现大量民间修改版。
- 护国神剑版：修改角色属性，增强可玩性
- 无限连版：允许无限连招，娱乐性强
- 乱舞版：大幅提升出招速度和攻击范围
注意：这些版本非官方发布，多用于模拟器娱乐。