三国战纪1：风云再起 (IGS 1.0 / 1.1)
最经典的版本，奠定了整个系列的基础。包含诸葛亮、赵云、关羽、张飞、马超、黄忠、魏延、刘备八位可选角色。
特色系统：剑法系统（风、火、雷、电、冰、爆、幻、斩）、奥义书、剑气、变身（青龙、白虎、朱雀、玄武、麒麟）。
注：1.0与1.1版本差异较小，1.1为修正版。
三国战纪2：英雄再临 (IGS 2.0)
在1代基础上大幅改进，画面、动作、系统全面升级。
新增角色：吕布、貂蝉、曹操、孙权、陆逊、小乔、周瑜、庞统、黄月英、孟获、祝融、张辽、夏侯惇、典韦等。
新增系统：双人合体技、武器系统、新剑法（毒、石、风、火、雷、电、冰、爆）、新变身（白蛇、凤凰、饕餮、穷奇）。
注：此版本为系列中内容最丰富、系统最完善的版本之一。
三国战纪：群雄争霸 (IGS 1.2x 系列)
基于1代引擎的改良版本，通常为1.20、1.21、1.22等小版本号。
主要变化：调整平衡性、修复BUG、部分角色招式微调、新增少量隐藏人物（如隐藏版赵云）。
部分版本加入简单的新剑法或修改了变身条件。
三国战纪：赤壁之战 (IGS 3.0)
系列后期作品，风格更偏向动作游戏，系统进一步简化。
角色数量减少，强调连招与动作流畅性。画面风格有所变化，音乐也重新制作。
此版本在核心玩家中评价较为两极分化，部分玩家认为失去了前作的策略性。
其他衍生版本
三国战纪：擂台争霸 - 以对战为主的版本，简化剧情模式。
三国战纪：七将传 - 非官方或MOD版本，整合多个角色与系统，流行于模拟器平台。
三国战纪Online - 后期推出的网络游戏版本，已停运。