1. 三国战纪：闯关三国（IGS-97）
发行时间：1998年
特点：系列初代作品，奠定基础玩法。包含诸葛亮、赵云、关羽、张飞、马超、黄忠、魏延、刘备八位可选角色。以闯关模式为主，BOSS为张辽。
备注：奠定了《三国战纪》的基本操作和连招系统，是后续版本的原型。
2. 三国战纪：风云再起（IGS-99）
发行时间：1999年
特点：最经典、流传最广的版本。新增剑张飞、火剑黄忠、雷剑马超、青龙关羽、卧龙诸葛亮等元素属性角色。引入卡片系统，可释放必杀技。新增司马懿、铁皮人、剑魔等强力BOSS。
备注：被广泛认为是系列巅峰之作，拥有最多的玩家群体和攻略资料。
3. 三国战纪2：英雄列传（IGS-2000）
发行时间：2000年
特点：系统大幅革新，取消卡片系统，改为能量槽释放必杀。新增角色如盖袁绍、曹操、貂蝉、庞统等。关卡设计更复杂，引入分支路线。
备注：操作手感与前作差异较大，评价较为两极分化。
4. 三国战纪：赤壁之战（未正式发行）
状态：测试版/未完成
特点：以赤壁之战为主题，角色和系统有较大改动。部分素材被用于后续作品。
备注：未正式发行，仅有少量测试ROM流出。
5. 三国战纪：擂台争霸
类型：衍生对战游戏
特点：类似《拳皇》的对战格斗模式，强调PVP。保留部分角色和技能，玩法完全不同。
备注：非闯关动作游戏，属于外传性质。
6. 移植与复刻版本
平台：PS2、PSP、手机、PC等
常见版本：
- 三国战纪：群英争霸 - PSP平台，整合风云再起内容并优化。
- 三国战纪Online - 网页/客户端游戏，加入RPG元素。
- 三国战纪HD - 手机平台高清复刻版，支持触控操作。
备注：移植版在画质和操作上有所调整，但核心玩法多基于“风云再起”。